図書館の西北に位置する灰色の洋館の建物が，附属図書館の尊攘堂である。京都に大学を興し，尊攘堂を設けようとした最初の人はかの吉田松陰であったが，その志を果さずに刑死した。しかし，刑死の1週間前，すなわち安政6年（1859）10月20日，江戸伝馬町の獄中より松陰は書を門下の入江子遠（通称丸市）に寄せ，その志を述べた。
　京師に大学校を興し，上天子，親王，公卿より下　武家，士民まで入寮寄宿等も出来候様致し，乍恐，天朝の御学風を天下の人々に知らせ，天下の奇才異能を，天朝の学校へ貢し候様致候得ば天下の人心一定仕るに相違なし云々

尊攘堂

　翌34年2月21日文部大臣松田正久はこれを許可して，京都帝国大学総長木下広次博士をして，その寄附を受理せしめた。
　明治30年6月京都に帝国大学が建設せられ，数年たらずで尊攘堂がその構内に新築され，蔵品全部を収容して永久に保存の途が立てられるに至ったことは，まことに奇しき縁ともいうべきで，ここに松陰の宿志は達せられ，品川子爵の企図も始めて成就するに至ったのである。
　明治34年6月に至り，品川弥一，野村靖，松本鼎および品川家の親族山県伊三郎，山根正次，中村精男，平田東助，および島地黙雷氏などの外，尊攘堂委員阿武素行氏以下31名は連署をもって，自今毎年10月27日（松陰忌）および2月26日（品川忌）の両日，尊攘堂を借受け，両先賢始め勤王諸烈士の祭典を営むこと，および同時に蔵品を陳列して，公衆に展覧せしめることの許可を京都帝国大学に改めて出願し，木下総長の許諾を得た。そこで前記諸員は翌35年3月会合協議の上，規約を設け，祭典資金として金3，000円を積み立て，毎年その利息をもって春秋2回の祭典費にあてること，その他祭典執行に関する詳細を協定し，この規約は委員歿後もその相続者が相承け，永くその履行に当ることを誓約した。この約定書に記名調印した委員は

子爵　　野村　　靖　　　子爵　品川　弥一　　　品川家親族　山県伊三郎
　 同　　山根　正次　　　同　　中村　精男　　　同　　男爵　　平田　東助
　　　　　島地　黙雷　　　（以上東京）
　　　　　松本　　鼎　　　　　　　阿武　素行　　　　　　　　　　　 伊藤　陶山
　　　　　林　　新助　　　　　　　田中治兵衛　　　　　　　　　 　 今井貞次郎
　　　　　八木　良則　　　　 　　深見伊兵衛　　　　　　　 　　　 西谷　成造
　　　　　伊藤平左衛門　　 　　飯田　新七　　　　　　　　　　　 清水六兵衛
　　　　　池田　清助　　　　 　　並河　靖之　　　　　　　　　　　 西村総左衛門
　　　　　川島甚兵衛　　　　　　斉藤卯兵衛　　　　　　　　 　　 田中　利七
　　　　　佐々木清七　　　　　　[辻]信次郎　　　　　　　　　　　 [辻]忠三郎
　　　　　[辻]忠四郎　　　　　 　安盛善兵衛　　　　　 　　　　　 川端　弥七
　　　　　内藤小四郎　　　　　　竹村弥兵衛　　　　　 　　　　　 藤村岩次郎
　　　　　綿貫　吉秋　　　　　 　吉田　佐吉　　　　　　　　　　　 鬼頭　玉汝
　　　　　神坂　吉隆　　　　　 　森　勇太郎　　　 （以上京都）

　明治36年4月大学構内の尊攘堂が竣工し，蔵品1，249点が移搬されることになり，木下総長は寄贈品を島館長に命じて，特別に保管せしめることとした。館長は安全を期するため，平時はこれを図書館内の貴重書庫に収蔵し，必要に応じ随時これを堂内に陳列することとした。その後毎年2回の祭典を年1回4月第1土曜日に執行することに改めた。さらに大正10年より毎年秋季10月27日松陰忌に小祭を営み，3年目に大祭を行うことに改め，保存委員を単に祭典委員とした。そして例祭小祭当日は吉田，品川両先賢（各木像安置）を始め，勤王諸家の霊を祀り，総長をはじめ，学部長，図書館長，教職員，旧尊攘堂委員等が参列し，大祭の際には前記の外，朝野の名士を招待して講演会を開き，遺品・遺墨の展覧会を催し，学内はもちろん一般の観覧を許した。また当日は参列者に志士遺墨にちなむ記念品を贈呈することにした。
　昭和12年はあたかも尊攘堂創立50周年に当り，盛大に大祭を執行したが，たまたま支那事変の勃発を見，時局はますます重大となったので，祭典委員は諸般の事情に鑑み，その資金を京都帝国大学に寄附し，自今大学側において適当な方法により，祭典を主催することとなった。そして昭和15年10月の大祭は，大学の主催による第1回の大祭であった。
　ついで昭和18年10月には大学による第2回大祭が，岡部文相を迎えて厳粛に執行されたが，維新勤王烈士の遺品・遺墨を一般に公開する事を要望する声が学内外に高まったので，この要望に応ずるため規定を設け，11月より公開小展観を，7，12月を除いて毎月27日の松陰忌の正午より4時まで実施することに決定し，第1回を開催した。翌19年6月戦局はますます不利な形勢を示すに至ったため，蔵品中の貴重品を保津川，嵯峨方面に疎開し，さらに昭和20年には1月，3月の小展観は警戒警報発令のため中止となり，終に8月わが国の無条件降伏により，尊攘堂前の石標（皇紀2600年記念）は除去され，同堂は図書陳列館と改称された。

尊攘堂年譜